RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 MAPK15Q8TD08 544 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 GLRA3O75311 464 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 CATP04040 527 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 RPN2P04844 631 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 C8GP07360 202 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 GIMD1P0DJR0 217 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TFEBP19484 476 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 BDKRB1P46663 353 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 CCT5P48643 541 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 SP140Q13342 867 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 LCA5Q86VQ0 697 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 SFRP1Q8N474 314 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 PHC3Q8NDX5 983 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 OR4C6Q8NH72 309 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ASB11Q8WXH4 323 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 APOPT1Q96IL0 206 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 SCYL1Q96KG9 808 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ALG9Q9H6U8 611 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 SPAG7O75391 227 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 VIPP01282 170 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 GSTA1P08263 222 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 CREB1P16220 341 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TGM1P22735 817 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ACAP2Q15057 778 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TTMPQ5BVD1 217 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 EID2Q8N6I1 236 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ARL10Q8N8L6 244 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 KYQ8NBH2 561 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1191Q96A73 305 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 PTERQ96BW5 349 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 TLCD1Q96CP7 247 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 GPR78Q96P69 363 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 HGH1Q9BTY7 390 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA4-202ENST00000428284 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM38O00635 465 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 NOBOXO60393 691 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2A7P20853 494 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 SLC19A1P41440 591 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 BIRC2Q13490 618 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 TTC23LQ6PF05 361 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 SBSNQ6UWP8 590 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 ISCA2Q86U28 154 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 BANPQ8N9N5 519 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 POT1Q9NUX5 634 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 GFYI3L273 518 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 SLC16A5O15375 505 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf105O95561 183 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 CRHR1P34998 444 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 PRKG2Q13237 762 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 OR4D1Q15615 310 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 INAVAQ3KP66 663 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms