RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 C9J4A7 227 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 F8VZ95 297 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCL21O00585 134 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PEX12O00623 359 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAFKO60675 156 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM155BO75949 473 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 WISP2O76076 250 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRLP01236 227 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBSLP0DN79 551 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 HTR7P34969 479 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBSP35520 551 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PBX1P40424 430 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPP1R2P41236 205 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CA7P43166 264 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MMP13P45452 471 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPINT3P49223 89 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 AIF1P55008 147 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPYSQ14117 519 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SSPNQ14714 243 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPE65Q16518 533 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MLIPQ5VWP3 458 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALS2CLQ60I27 953 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GFRALQ6UXV0 394 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 WASH2PQ6VEQ5 465 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPTNQ6XPR3 784 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MON1BQ7L1V2 547 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CEP97Q8IW35 865 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SULF2Q8IWU5 870 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 BCORP1Q8N888 145 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 C3orf20Q8ND61 904 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR26Q8NDV2 337 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NR4A3Q92570 626 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 HDAC11Q96DB2 347 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF599Q96NL3 588 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 IP6K3Q96PC2 410 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GBP5Q96PP8 586 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 VPS16Q9H269 839 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CHKBQ9Y259 395 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 BTRCQ9Y297 605 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SVILO95425 2214 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6C74A6NCV1 312 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KMOO15229 486 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DAPK3O43293 454 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF749O43361 778 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 HCRTR1O43613 425 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLHL41O60662 606 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GFPT2O94808 682 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 UNC5CO95185 931 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR89BP0CG08 455 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PVRP15151 417 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 UCHL3P15374 230 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms