RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBED6P86452 979 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTKQ06187 659 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 STARD3Q14849 445 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM83BQ5T0W9 1011 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC38A9Q8NBW4 561 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 AFG1LQ8WV93 481 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGK494Q96LW2 274 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYNNQ9NPC7 610 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MIOSQ9NXC5 875 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC36A6NLP5 189 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM49D1C9J1S8 452 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 STAM2O75886 525 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCGB1D2O95969 90 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 RENP00797 406 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALTP07902 379 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 UMPSP11172 480 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 HRH2P25021 359 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPOXP50336 477 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CTXN3Q4LDR2 81 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPECC1Q5M775 1068 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2C3Q8N628 320 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGEB18Q96M61 343 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MROH8Q9H579 483 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM90A7PA6NKC0 464 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM90A22PA8MWA6 464 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM90A12PA8MX19 464 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAF4O00268 1085 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEACAM4O75871 244 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCNT3O95395 438 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCP11498 1178 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERVPABLB-1P60509 514 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF33BQ06732 778 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 BLMHQ13867 455 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAMK1Q14012 370 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF667Q5HYK9 610 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF691Q5VV52 312 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIPK1Q86Z02 1210 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOMEZQ8IX15 550 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 AFAP1L1Q8TED9 768 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 C10orf90Q96M02 699 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM39BQ9GZU3 492 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 OBP2BQ9NPH6 170 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 OBP2AQ9NY56 170 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 VNN3Q9NY84 501 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2M5A3KFT3 312 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPHB6O15197 1021 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB43O43298 467 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CA11O75493 328 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRDM1O75626 825 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACHEP22303 614 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMC4P43686 418 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP4BP51164 291 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC16Q13042 620 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TFAP2EQ6VUC0 442 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNIP2Q8NFZ5 429 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 BRINP2Q9C0B6 783 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPVLQ9H3G5 476 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGIXQ9H6Y5 334 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHODLQ9H9P2 273 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC28A3Q9HAS3 691 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLSCR3Q9NRY6 295 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CUTCQ9NTM9 273 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 C20orf141Q9NUB4 165 aa0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms