RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 NAGSQ8N159 534 aa28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 PATE1Q8WXA2 126 aa28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEB18Q96M61 343 aa28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM9BQ9NQ34 198 aa28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 IRF9Q00978 393 aa28.87■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 UBXN10Q96LJ8 280 aa28.87■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 MLXIPLQ9NP71 852 aa28.87■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 NLGN3Q9NZ94 848 aa28.87■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 CYHR1Q6ZMK1 362 aa28.86■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 NEK10Q6ZWH5 1172 aa28.86■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 OR4C6Q8NH72 309 aa28.84■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 MATN4O95460 622 aa28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 EID2Q8N6I1 236 aa28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JNG1 304 aa28.83■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DS3K7RE56 304 aa28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 NOBOXO60393 691 aa28.83■■■□□ 2.21
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DS5Q14953 304 aa28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 FOPNLQ96NB1 174 aa28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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ECHS1-201ENST00000368547 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 DBX2Q6ZNG2 339 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 NXNL1Q96CM4 212 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP6Q96FZ7 201 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF5Q9NSI5 407 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 IKZF3Q9UKT9 509 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 EMCNQ9ULC0 261 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD3Q9Y2F9 522 aa28.82■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 C4orf47A7E2U8 309 aa28.81■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 BIRC5O15392 142 aa28.81■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 PLIN3O60664 434 aa28.81■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
ECHS1-201ENST00000368547 CD1DP15813 335 aa28.81■■■□□ 2.2
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