RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDR2Q01850 454 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKCZQ05513 592 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMPKQ09013 629 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPS8Q12929 822 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RY6Q15077 328 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEA1Q16626 185 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC16A9Q7RTY1 509 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP57Q86XR8 500 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAGAPQ8N103 731 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIML1Q8N9V2 468 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRHL3Q8TE85 626 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF653Q96CK0 615 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALML4Q96GE6 196 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAC1Q96KF2 57 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF599Q96NL3 588 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDRT15Q96T59 188 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX12Q9BXU0 123 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAT2Q9GZY6 243 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP27Q9H306 513 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN1O60635 241 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJB3O75712 270 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP2A2O94973 939 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPOP07202 933 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA4P22748 312 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A6P31641 620 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEA11P43364 429 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLK1P49759 484 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMXP51813 675 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAT2P52630 851 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL4AQ13619 759 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTRK2Q16620 822 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGSF11Q5DX21 431 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HYIQ5T013 277 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZSR9 355 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD8Q8NFY9 601 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13J1Q8NGT2 312 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T11Q8NH01 316 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTBD10Q9BSF8 475 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR34Q9UPC5 381 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIPK3Q9Y572 518 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFAF8A1L188 74 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKUB1A6NFN9 424 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCL10O95999 233 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAF1P04049 648 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP3Q02447 781 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPARDQ03181 441 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAPQ13588 217 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX38Q6PEX7 206 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 COMMD2Q86X83 199 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00346Q8IVM7 164 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCML4Q8N228 414 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF611Q8N823 705 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms