RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356940.10

RAB18-201, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB18, Length 4,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18-201ENST00000356940 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 21.8
RAB18-201ENST00000356940 ZNF599Q96NL3 588 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PLK4O00444 970 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 GRK3P35626 688 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 NFATC3Q12968 1075 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DNASE1L3Q13609 305 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ACOX1Q15067 660 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 COLEC12Q5KU26 742 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 RNFT2Q96EX2 444 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TMEM248Q9NWD8 314 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CITO14578 2027 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 XPNPEP2O43895 674 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 GPR32O75388 356 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DIRAS1O95057 198 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 NFKB2Q00653 900 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PM20D1Q6GTS8 502 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 OR2T29Q8NH02 315 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 NACC2Q96BF6 587 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TCF25Q9BQ70 676 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SGK2Q9HBY8 427 aa10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PSMD11O00231 422 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DFNA5O60443 496 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CDH12P55289 794 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PTGR1Q14914 329 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CLDN19Q8N6F1 224 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SUSD3Q96L08 255 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TTPALQ9BTX7 342 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 RMI1Q9H9A7 625 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SSR3Q9UNL2 185 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 H3BMQ9 156 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ADAMDEC1O15204 470 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 EPOP01588 193 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 POU2F1P14859 743 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 OXTRP30559 389 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 NDUFA5Q16718 116 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PPCDCQ96CD2 204 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 COG8Q96MW5 612 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 RDH12Q96NR8 316 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ZNF221Q9UK13 617 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CYP7B1O75881 506 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 KCNQ1P51787 676 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 VBP1P61758 197 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SERINC3Q13530 473 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 LSMEM2Q8N112 164 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PYCR2Q96C36 320 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 FBP2O00757 339 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 PTGESO14684 152 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 FDXRP22570 491 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RAB18-201ENST00000356940 GRIA2P42262 883 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms