RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TM9SF3Q9HD45 589 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NANSQ9NR45 359 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC39A1Q9NY26 324 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP15Q460N3 678 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN20Q4JDL3 420 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MIB1Q86YT6 1006 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NAT16Q8N8M0 369 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CD247P20963 164 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NCS1P62166 190 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP1B1Q16678 543 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AP5B1Q2VPB7 878 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IL23RQ5VWK5 629 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MIOSQ9NXC5 875 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C3P01024 1663 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM234BA2RU67 622 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DNASE1L1P49184 302 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF404Q494X3 552 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GPER1Q99527 375 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SULT1C2O00338 296 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DENRO43583 198 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ALG10Q5BKT4 473 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FPGTO14772 594 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CSF1RP07333 972 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK2P24941 298 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 POU4F2Q12837 409 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BTBD16Q32M84 506 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNN3Q9UGI6 736 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 EI24O14681 340 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCB7O75027 752 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 UBXN7O94888 489 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKL1Q00532 357 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FMO1Q01740 532 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE2J2Q8N2K1 259 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52K1Q8NGK4 314 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GAD1Q99259 594 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1I1O60431 355 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6AP2O75787 350 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CLDN9O95484 217 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MT-ND2P03891 347 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CD79BP40259 229 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 E2F1Q01094 437 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ART5Q96L15 291 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DLSTP36957 453 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IL17AQ16552 155 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PHOX2BQ99453 314 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BTRCQ9Y297 605 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRTM2O43300 516 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 XYLBO75191 536 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB39AQ14964 217 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms