RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.62■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PADI4Q9UM07 663 aa15.62■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 GPR34Q9UPC5 381 aa15.62■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.62■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 HMX2A2RU54 273 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KPNA5O15131 536 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SLC28A2O43868 658 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CHRM3P20309 590 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 RAB10P61026 200 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KCNC4Q03721 635 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CLN3Q13286 438 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 RAPH1Q70E73 1250 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CYP4X1Q8N118 509 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 MZB1Q8WU39 189 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ISL2Q96A47 359 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CABS1Q96KC9 395 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 LRRC61Q9BV99 259 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 WDR70Q9NW82 654 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KLQ9UEF7 1012 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TLK1Q9UKI8 766 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.61■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KLHL33A6NCF5 533 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TMEM202A6NGA9 273 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TNFRSF10CO14798 259 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CHUKO15111 745 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KMOO15229 486 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 YY2O15391 372 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 GRID2O43424 1007 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SGTAO43765 313 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CEACAM5P06731 702 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 BLKP51451 505 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CTSCP53634 463 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CDKN2DP55273 166 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PPARDQ03181 441 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TTLL9Q3SXZ7 439 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TRABD2AQ86V40 505 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KRT222Q8N1A0 295 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 NAT14Q8WUY8 206 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 GPR21Q99679 349 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 OLFM1Q99784 485 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 MED4Q9NPJ6 270 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 MGAQ8IWI9 3026 aa15.6■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 LRP4O75096 1905 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 A0A087X1B8 175 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PRSS38A1L453 326 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 IQCF5A8MTL0 148 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC6O75061 913 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 RFPL1O75677 317 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 VCLP18206 1134 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ITGB6P18564 788 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 MAGEA12P43365 314 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PDX1P52945 283 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SYTL3Q4VX76 610 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 PIM3Q86V86 326 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CEP97Q8IW35 865 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB2Q8N680 514 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ARL10Q8N8L6 244 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 ELMO1Q92556 727 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 INPP5DQ92835 1189 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 FAM136AQ96C01 138 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 OR2M4Q96R27 311 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 SMC6Q96SB8 1091 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.59■□□□□ 0.09
IFT20-201ENST00000322326 STRADBQ9C0K7 418 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms