RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTX2O75431 263 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNFAIP8O95379 198 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 CAPN3P20807 821 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 CARD16Q5EG05 197 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF366Q8N895 744 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRD9Q9H8M2 597 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACADVLP49748 655 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNK10P57789 538 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 BNIP3Q12983 259 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTF2H2Q13888 395 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHKG1Q16816 387 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM16LQ309B1 348 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 SBSNQ6UWP8 590 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 IRF7Q92985 503 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCRN2Q96FV2 425 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 COPS8Q99627 209 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTG2Q9H4K7 406 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPCAMP16422 314 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLIN5Q00G26 463 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 NR6A1Q15406 480 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 LHCGRP22888 699 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GID8Q9NWU2 228 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTR6P50406 440 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ASB9Q96DX5 294 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP290O15078 2479 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS4BO75351 444 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GMNNO75496 209 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSNK1DP48730 415 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 NR1H2P55055 460 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 UFM1P61960 85 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2T11Q8NH01 316 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 C5orf42Q9H799 3197 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 OBSL1O75147 1896 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLK8O60259 260 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 IRS1P35568 1242 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTSQ03393 145 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFYCQ13952 458 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAMM41Q96BW9 452 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 NNMTP40261 264 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP4BP51164 291 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR33Q49SQ1 333 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ULK4Q96C45 1275 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEX37Q96LM6 180 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 Q9H521 79 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR70Q9NW82 654 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 OPTCQ9UBM4 332 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 GBF1Q92538 1859 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACOT8O14734 319 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms