RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LHPPQ9H008 270 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOXL2P58012 376 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPYSL3Q14195 570 aa14.87□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.87□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DET1Q7L5Y6 550 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCTD6Q8NC69 237 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR2L2Q8NH16 312 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VPS50Q96JG6 964 aa14.87□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IL26Q9NPH9 171 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BTN3A1O00481 513 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDST3O95803 873 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD1EP15812 388 aa14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GBE1Q04446 702 aa14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB17Q13105 803 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.031e-17■■□□□ 12.3
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPR39O43194 453 aa14.85□□□□□ -0.03
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AP1B1Q10567 949 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MFAP5Q13361 173 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP97Q8IW35 865 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BTBD6Q96KE9 485 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDC1Q9BTX1 674 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRABDQ9H4I3 376 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FANCLQ9NW38 375 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.85□□□□□ -0.03
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