RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516724.1

RNU6-572P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 572, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-572P, Length 80 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-572P-201ENST00000516724 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MMP15P51511 669 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIF5AQ12840 1032 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIR2DS5Q14953 304 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC39A14Q15043 492 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIF19Q2TAC6 998 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CCDC184Q52MB2 194 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SATL1Q86VE3 508 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PTOV1Q86YD1 416 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF611Q8N823 705 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 NEUROG1Q92886 237 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPSB1Q96BD6 273 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF479Q96JC4 524 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MUS81Q96NY9 551 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 FEVQ99581 238 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CD93Q9NPY3 652 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 KLHL1Q9NR64 748 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 OSER1Q9NX31 292 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MALT1Q9UDY8 824 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SNX7Q9UNH6 387 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 HYKKA2RU49 373 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CTAGE9A4FU28 777 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ASPDHA6ND91 283 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 NEMP2A6NFY4 417 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CLIC2O15247 247 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 STX6O43752 255 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ALPLP05186 524 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LIPFP07098 398 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 KRT19P08727 400 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CTAGE8P0CG41 777 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SAGP10523 405 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PDGFRAP16234 1089 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CASTP20810 708 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ATP5DP30049 168 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 HTR6P50406 440 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ART1P52961 327 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 NAGLUP54802 743 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 DSCR9P59020 149 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LINC00205P59089 165 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 GAGE5Q13069 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 GAGE6Q13070 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZBTB17Q13105 803 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MFAP5Q13361 173 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MPP7Q5T2T1 576 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MOXD1Q6UVY6 613 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 TLK2Q86UE8 772 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LONP2Q86WA8 852 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 COMMD2Q86X83 199 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CTAGE4Q8IX94 777 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 TIGD4Q8IY51 512 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 GDAP1Q8TB36 358 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 CCDC107Q8WV48 283 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LINGO1Q96FE5 620 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 MED30Q96HR3 178 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 LYZL4Q96KX0 146 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-572P-201ENST00000516724 SGK494Q96LW2 274 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms