RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PCSK4Q6UW60 755 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CREG2Q8IUH2 290 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4E2Q8NGC2 313 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC12Q96GR4 267 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C1Q96RD1 312 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ICKQ9UPZ9 632 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ATRXP46100 2492 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TLCD2A6NGC4 264 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 K7ENP7 123 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 QSOX1O00391 747 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TIAF1O95411 115 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTM1P09488 218 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 EBLN1P0CF75 366 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TPBGLP0DKB5 382 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFS1P28331 727 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGIRP43119 386 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CD151P48509 253 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTM4Q03013 218 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PTK6Q13882 451 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT33BQ14525 404 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R7Q15435 360 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CASC4Q6P4E1 433 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MCUQ8NE86 351 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LCN9Q8WX39 176 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 NKD1Q969G9 470 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRY4Q9C004 299 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PILRAQ9UKJ1 303 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GSAPA4D1B5 854 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 AP3B1O00203 1094 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD1O60671 282 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 STK17BO94768 372 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 DLGAP3O95886 979 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 FOLR1P15328 257 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TTPAP49638 278 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MANEAQ5SRI9 462 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL35Q6PF15 583 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL7Q8IXQ5 586 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LPGAT1Q92604 370 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM136AQ96C01 138 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MVB12BQ9H7P6 319 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 POMT2Q9UKY4 750 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ASF1AQ9Y294 204 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KALRNO60229 2985 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT87PA6NCN2 255 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 NIPSNAP2O75323 286 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MLNP12872 115 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LIFP15018 202 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB3Q13509 450 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFPM2Q8WW38 1151 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 UBXN4Q92575 508 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO2A1Q92959 643 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BIRC8Q96P09 236 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms