RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 HSD17B4P51659 736 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 GRTP1Q5TC63 336 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 LPGAT1Q92604 370 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 NSL1Q96IY1 281 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 MXD3Q9BW11 206 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PDE7BQ9NP56 450 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.07□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PATE4P0C8F1 98 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 RNF224P0DH78 156 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ACP2P11117 423 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ITGA3P26006 1051 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 SLC6A6P31641 620 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 PMP22Q01453 160 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TAF13Q15543 124 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 CORO6Q6QEF8 472 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PCGF5Q86SE9 256 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 EXD1Q8NHP7 514 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 RNF128Q8TEB7 428 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 RPS6KA6Q9UK32 745 aa4.06□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 WDR81Q562E7 1941 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PASKQ96RG2 1323 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 A0A1W2PN81 502 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 HYKKA2RU49 373 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PLOD2O00469 737 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 XRCC3O43542 346 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 AHCYL1O43865 530 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 STARD3NLO95772 234 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 CHRNA7P36544 502 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 SLC9A3P48764 834 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 ATP12AP54707 1039 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 CX3CL1P78423 397 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TRIM58Q8NG06 486 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 TMCO6Q96DC7 493 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTEN-204ENST00000487939 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.05□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 HHLA1C9JL84 531 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 E9PI62 339 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 SLC22A2O15244 555 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 PIGNO95427 931 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 BCL10O95999 233 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 CLPTM1O96005 669 aa4.04□□□□□ -1.76
PTEN-204ENST00000487939 LIG4P49917 911 aa4.04□□□□□ -1.76
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