RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484109.1

ABCC4-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 4, human

TSL 2

Gene ABCC4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC4-205	ENST00000484109	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109		E9PI62	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ZWINT	O95229	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PIGN	O95427	931 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SLC15A1	P46059	708 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	BMX	P51813	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CDR2	Q01850	454 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CTDSP2	O14595	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	GABRA5	P31644	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	RXRG	P48443	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	P2RY6	Q15077	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109		A0A087WW49	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109		A0A1W2PQ09	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109		A6NCN8	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	XRCC3	O43542	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	AP2A2	O94973	939 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	RAF1	P04049	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	KRT5	P13647	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	MC1R	Q01726	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CXCL9	Q07325	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	DMPK	Q09013	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	HYKK	A2RU49	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CREG1	O75629	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	VPREB1	P12018	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CEBPB	P17676	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	GCH1	P30793	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	ARSE	P51690	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SIRPA	P78324	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CREB5	Q02930	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PPARD	Q03181	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	GPR17	Q13304	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	TAF13	Q15543	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	SCML4	Q8N228	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCC4-205	ENST00000484109	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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