RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483738.1

UBIAD1-203, Transcript of UbiA prenyltransferase domain containing 1, human

TSL 3

Gene UBIAD1, Length 1,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBIAD1-203	ENST00000483738	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPS2	Q13227	327 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	CPZ	Q66K79	652 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	MED25	Q71SY5	747 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	SNX20	Q7Z614	316 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	LRFN5	Q96NI6	719 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	TTC1	Q99614	292 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	NLN	Q9BYT8	704 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	POMT2	Q9UKY4	750 aa		10.47	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	FLNC	Q14315	2725 aa		10.46	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	SEC16A	O15027	2179 aa		10.46	□□□□□ -0.73
UBIAD1-203	ENST00000483738	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738		A6NL46	340 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738		K7EM74	188 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PEX12	O00623	359 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF185	O15231	689 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TJP3	O95049	919 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ALPP	P05187	535 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GSTM1	P09488	218 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RBP3	P10745	1247 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GNLY	P22749	145 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PSMB4	P28070	264 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	MC4R	P32245	332 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	VAV2	P52735	878 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GSTM4	Q03013	218 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	IL10RA	Q13651	578 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TAZ	Q16635	292 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPR33	Q49SQ1	333 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	NXPE1	Q8N323	547 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	HGH1	Q9BTY7	390 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	COG4	Q9H9E3	785 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TCFL5	Q9UL49	500 aa		10.46	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	FTH1	P02794	183 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	OTX2	P32243	289 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	CD151	P48509	253 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	LMAN1	P49257	510 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RWDD2B	P57060	319 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RPA4	Q13156	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TM9SF4	Q92544	642 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPATA13	Q96N96	652 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRIM5	Q9C035	493 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	BTN3A1	O00481	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PJA2	O43164	708 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PSMD3	O43242	534 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	SHMT2	P34897	504 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	FOLR3	P41439	243 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRKG2	Q13237	762 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UBIAD1-203	ENST00000483738	NCF4	Q15080	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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