RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	C9	P02748	559 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	AHSG	P02765	367 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PROS1	P07225	676 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	THRA	P10827	490 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CD9	P21926	228 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SSTR1	P30872	391 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MAGEA4	P43358	317 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CLCN7	P51798	805 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LIMK2	P53671	638 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	INHBC	P55103	352 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GPX6	P59796	221 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CUL1	Q13616	776 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PLCL1	Q15111	1095 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC25	Q86WR0	208 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RELL1	Q8IUW5	271 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PALM2	Q8IXS6	379 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZBTB2	Q8N680	514 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RSC1A1	Q92681	617 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	C9orf72	Q96LT7	481 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	FMO2	Q99518	471 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RAB33B	Q9H082	229 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GALP	Q9UBC7	116 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ASF1A	Q9Y294	204 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PSAT1	Q9Y617	370 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR5K3	A6NET4	321 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	FAM159B	A6NKW6	160 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	VPS26A	O75436	327 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SPAG6	O75602	509 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CHRM3	P20309	590 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MAPK9	P45984	424 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KRT33B	Q14525	404 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RTP5	Q14D33	572 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KLHL35	Q6PF15	583 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	USP53	Q70EK8	1073 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CD200R1	Q8TD46	325 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	FAM136A	Q96C01	138 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NXPE2	Q96DL1	559 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLC30A3	Q99726	388 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	HGH1	Q9BTY7	390 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	STRADB	Q9C0K7	418 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZMYND15	Q9H091	742 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	POLG2	Q9UHN1	485 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DHRS7	Q9Y394	339 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SPTBN2	O15020	2390 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PTPRB	P23467	1997 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SPEG	Q15772	3267 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93

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