RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 GNGT1P63211 74 aa6.9□□□□□ -1.3
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SHQ1-207ENST00000475558 BMPR2Q13873 1038 aa6.9□□□□□ -1.3
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SHQ1-207ENST00000475558 J3QL48 77 aa6.89□□□□□ -1.31
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 ISCA2Q86U28 154 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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