RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K3Q99759 626 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF670Q9BS34 389 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 RAB33BQ9H082 229 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 KCND3Q9UK17 655 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 A1L4Q6 167 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ARGFXA6NJG6 315 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 C21orf140B9A014 251 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MYO1FO00160 1098 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 VPS4BO75351 444 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MTA2O94776 668 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PROSCO94903 275 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CDK14O94921 469 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 AGFG2O95081 481 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CA4P22748 312 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 KDELR1P24390 212 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CASP14P31944 242 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PBX1P40424 430 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CCL11P51671 97 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CTSCP53634 463 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GSTM4Q03013 218 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GPS2Q13227 327 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TUBB3Q13509 450 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RPE65Q16518 533 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FHL5Q5TD97 284 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NPNTQ6UXI9 565 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 Q8NA96 180 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 AVL9Q8NBF6 648 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RNF214Q8ND24 703 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CCNYQ8ND76 341 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NAT14Q8WUY8 206 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RNF157Q96PX1 679 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 LUZP4Q9P127 313 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 VPS4AQ9UN37 437 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 A6NHS1 94 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 VEGFDO43915 354 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A9O60656 530 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN15O95858 294 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN1P07384 714 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GPR89BP0CG08 455 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A6P19224 532 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 IDSP22304 550 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A1P22309 533 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A4P22310 534 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PTPN4P29074 926 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CD96P40200 585 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CDK18Q07002 472 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NFE2L1Q14494 772 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 IQCB1Q15051 598 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PDK2Q15119 407 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GPR19Q15760 415 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FIGNQ5HY92 759 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 AGAP3Q96P47 875 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 VPS35Q96QK1 796 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NRTNQ99748 197 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FGF21Q9NSA1 209 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UBP1Q9NZI7 540 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms