RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414558.2

ATG4C-204, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4C, Length 464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4C-204	ENST00000414558	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PAK5	Q9P286	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ZFAND5	O76080	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SLC6A12	P48065	614 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	DLG2	Q15700	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558		Q6ZSR9	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SUSD6	Q92537	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558		E9PI62	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SSX4	O60224	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MMP9	P14780	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MAGEA11	P43364	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	DCAF7	P61962	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	VGLL1	Q99990	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	KLF11	O14901	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MAPK4	P31152	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SNX16	P57768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LMO4	P61968	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CX3CL1	P78423	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	SP3	Q02447	781 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	EGFL8	Q99944	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	VPREB1	P12018	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	MFAP4	P55083	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4C-204	ENST00000414558	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	CA4	P22748	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	CA6	P23280	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	SLC6A6	P31641	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	PSMB10	P40306	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	SUOX	P51687	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	ARSE	P51690	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	PDX1	P52945	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG4C-204	ENST00000414558	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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