RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-201ENST00000380701 ACRP10323 421 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 NRLP54845 237 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SEC13P55735 322 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PLGLB1Q02325 96 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FLCNQ8NFG4 579 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SLC9A6Q92581 669 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 RNF31Q96EP0 1072 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 DGAT2Q96PD7 388 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GPER1Q99527 375 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PRODH2Q9UF12 536 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF726A6NNF4 738 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 LILRB3O75022 631 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 JMJD7P0C870 316 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GRIA2P42262 883 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 DNASE1L1P49184 302 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZBTB6Q15916 424 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 IFI44LQ53G44 452 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 C1orf74Q96LT6 269 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 AGAP2Q99490 1192 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GLS2Q9UI32 602 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 A0A0J9YYE9 177 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SLC16A5O15375 505 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SH3BGRLO75368 114 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 DCKP27707 260 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 IL12AP29459 219 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 LPIN1Q14693 890 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF567Q8N184 647 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 OR2AG1Q9H205 316 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PDE7BQ9NP56 450 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 UPB1Q9UBR1 384 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 KDELR3O43731 214 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 NBNO60934 754 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ALPPP05187 535 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 JAM2P57087 298 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 CYP4F8P98187 520 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MAPK14Q16539 360 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SGCBQ16585 318 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MAPK15Q8TD08 544 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MSANTD3Q96H12 275 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 BTRCQ9Y297 605 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 AREL1O15033 823 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TACSTD2P09758 323 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 LINC00032P0C843 101 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 NRIP1P48552 1158 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 DECR1Q16698 335 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 KLHL22Q53GT1 634 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SERINC5Q86VE9 423 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 PJA1Q8NG27 643 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 SCLYQ96I15 445 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 TSSK3Q96PN8 268 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC171-201ENST00000380701 RNF186Q9NXI6 227 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms