RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAP23O00161 211 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFECO14948 347 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAP91O60641 907 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRDM1O75626 825 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DFFBO76075 338 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHEP01854 428 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNPP09543 421 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LHCGRP22888 699 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CA6P23280 308 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HRH2P25021 359 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRNA7P36544 502 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOX3P41225 446 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KHKP50053 298 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNAQP50148 359 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKCZQ05513 592 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTKQ06187 659 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TDGQ13569 410 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF13Q15543 124 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A53Q5H9E4 307 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYSMD4Q5XG99 296 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAUS6Q7Z4H7 955 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRLQ86TD4 932 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFAND4Q86XD8 727 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSCBQ8IWL3 235 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENTHD1Q8IYW4 607 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HM13Q8TCT9 377 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK15Q8TD08 544 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP11Q8TF27 550 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUBCNQ92622 972 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAMQ92783 540 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RILPL2Q969X0 211 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCC1Q96CN9 775 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALML4Q96GE6 196 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf90Q96M02 699 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP295NLQ96MC4 621 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATF6BQ99941 703 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIL1Q9H173 461 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC6A13Q9NSD5 602 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTSE1Q9NYZ3 720 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF581Q9P0T4 197 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJD2Q9UKL4 321 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 WIPI2Q9Y4P8 454 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLIC4Q9Y696 253 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAKO14976 1311 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PQ67 120 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PRB8 838 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KANSL1LA0AUZ9 987 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD62A6NC57 917 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVV-1B6SEH8 477 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP17L23D6RBM5 183 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 G3V2L1 256 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP2A1O14983 1001 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLPP2O43688 288 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF217O75362 1048 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNDBP1O95273 360 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC24AO95486 1093 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSTBP04080 98 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICAM1P05362 532 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD3B1P14060 373 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL7RP16871 459 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDHA2P29803 388 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-FP30511 346 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMC4P43686 418 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSFMP43897 325 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAP62937 165 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK2BP67870 215 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICA1Q05084 483 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2V1Q13404 147 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EBI3Q14213 229 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD1Q15327 319 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM182AQ5T1J6 154 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD45Q5TZF3 282 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CES4AQ5XG92 561 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLC3Q6P597 504 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A25Q6T423 547 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF561Q8N587 486 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXD1Q8NHP7 514 aa0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms