RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SIN3BO75182 1162 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 C1QTNF8P60827 252 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.25■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 MYO9BQ13459 2157 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 C9J4A7 227 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 DNAJA2O60884 412 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ACP5P13686 325 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 XKRYO14609 159 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PLIN3O60664 434 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CCNKO75909 580 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 HTRA1Q92743 480 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PPM1MQ96MI6 270 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CITED4Q96RK1 184 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 AGAP2Q99490 1192 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 M0R2N6 131 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CPN2P22792 545 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 MYBPC1Q00872 1141 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FOXN2P32314 431 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM129CQ86XR2 697 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.24■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TNFP01375 233 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 GALTP07902 379 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 KCNQ1P51787 676 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBTB6Q15916 424 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKHQ9HCJ1 492 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 AP1S2P56377 157 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PPM1JQ5JR12 505 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 C1orf109Q9NX04 203 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 C9IYK1 514 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FANCGO15287 622 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM155BO75949 473 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 VIPR1P32241 457 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 JAG1P78504 1218 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TEAD2Q15562 447 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 EML3Q32P44 896 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 OAFQ86UD1 273 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIB2Q92519 343 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 GIMD1P0DJR0 217 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 RHAGQ02094 409 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TAB1Q15750 504 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TDRPQ86YL5 185 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TWNKQ96RR1 684 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 C8orf4Q9NR00 106 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.23■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CACNA1FO60840 1977 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 PPEF2O14830 753 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF623O75123 536 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 TYRP14679 529 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 INCA1Q0VD86 236 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 CARTPTQ16568 116 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 MYLK3Q32MK0 819 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 MTX3Q5HYI7 312 aa20.22■□□□□ 0.83
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms