RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TPGS2Q68CL5 300 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 METTL23Q86XA0 190 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TRPV3Q8NET8 790 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 OR8K5Q8NH50 307 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ST8SIA4Q92187 359 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 SLC35C1Q96A29 364 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 OXTRP30559 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 WSCD1Q658N2 575 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SLCO2A1Q92959 643 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 C7orf72A4D263 438 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 KYAT1Q16773 422 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 MIB1Q86YT6 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 SENP8Q96LD8 212 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 MTRRQ9UBK8 725 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 UBE4BO95155 1302 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PIRO00625 290 aa7.12□□□□□ -1.27
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