RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK13Q9HB14 408 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FGF22Q9HCT0 170 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ESYT3A0FGR9 886 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 F10P00742 488 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SATB2Q9UPW6 733 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF860A6NHJ4 632 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 BTBD16Q32M84 506 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 TRIM40Q6P9F5 258 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 PHF21BQ96EK2 531 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LINGO1Q96FE5 620 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PTCHD1Q96NR3 888 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 POLG2Q9UHN1 485 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM202A6NGA9 273 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OR51F1A6NGY5 319 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SYCE1LA8MT33 242 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RAD51CO43502 376 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GMFGO60234 142 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RAD1O60671 282 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MATN4O95460 622 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TUBBP07437 444 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ETS1P14921 441 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PVRP15151 417 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1C1P21283 382 aa4.34□□□□□ -1.71
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