RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GSTA4O15217 222 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SLC25A27O95847 323 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PWP1Q13610 501 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 POC5Q8NA72 575 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 LGALS12Q96DT0 336 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 IPPQ9Y573 584 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 E9PAM4 449 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD28O15084 1053 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SLC16A6O15403 523 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CHEK2O96017 543 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CYP11A1P05108 521 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 TGFBR2P37173 567 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GBX1Q14549 363 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 HMCESQ96FZ2 354 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 TTC3P53804 2025 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 M0QX08 132 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GRK3P35626 688 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CASP3P42574 277 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 HK3P52790 923 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DPP9Q86TI2 863 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 EID3Q8N140 333 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PGBD5Q8N414 524 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 MCFD2Q8NI22 146 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 FAM162AQ96A26 154 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 MYLPFQ96A32 169 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DUSP21Q9H596 190 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 TESMINQ9Y4I5 508 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GBF1Q92538 1859 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 BTN3A1O00481 513 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 RHOBTB1O94844 696 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 LCKP06239 509 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 FMO4P31512 558 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PHC1P78364 1004 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GTDC1Q4AE62 458 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DESI1Q6ICB0 168 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DET1Q7L5Y6 550 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 LACC1Q8IV20 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 C10orf111Q8N326 155 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GAD1Q99259 594 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DERL2Q9GZP9 239 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SP110Q9HB58 689 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 IL37Q9NZH6 218 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 OPTCQ9UBM4 332 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ARNTLO00327 626 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NEK2P51955 445 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 FCGRTP55899 365 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GALNT3Q14435 633 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NDUFA5Q16718 116 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CES5AQ6NT32 575 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 TP53INP1Q96A56 240 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ASNA1O43681 348 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CYP2C18P33260 490 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 STC1P52823 247 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 IL1RL1Q01638 556 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PON2Q15165 354 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PLD3Q8IV08 490 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 MYOCQ99972 504 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.15■□□□□ 0.82
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