RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	HM13	Q8TCT9	377 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf50	Q9BV19	199 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEH1	Q9H213	219 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SP140L	Q9H930	580 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0B4J203	849 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DRGX	A6NNA5	263 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DQB2	P05538	268 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	APRT	P07741	180 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTM1	P09488	218 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PTGIR	P43119	386 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPKAPK2	P49137	400 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BMX	P51813	675 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BLVRA	P53004	296 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GDF10	P55107	478 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TPTE	P56180	551 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF33A	Q06730	810 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAP	Q12770	1279 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRCAP	Q14761	206 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	STAT4	Q14765	748 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MPP7	Q5T2T1	576 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NEK5	Q6P3R8	708 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS33	Q8NF86	280 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MAML1	Q92585	1016 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO19	Q96H55	970 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DOK1	Q99704	481 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF670	Q9BS34	389 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM64B	A6NI03	449 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5K4	A6NMS3	321 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	EVPLL	A8MZ36	301 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR39	O43194	453 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PSTPIP1	O43586	416 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL41	O60662	606 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MAFK	O60675	156 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC4	O95801	387 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NFKB1	P19838	968 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CRADD	P78560	199 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGAD	Q13349	1161 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NFE2L1	Q14494	772 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PARP15	Q460N3	678 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CARD16	Q5EG05	197 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CASC4	Q6P4E1	433 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	IYD	Q6PHW0	289 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARC	Q7LC44	396 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ALG14	Q96F25	216 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TXNDC15	Q96J42	360 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CNBD2	Q96M20	576 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	THTPA	Q9BU02	230 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	IL36A	Q9UHA7	158 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN8	A6NHC0	703 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CCRL2	O00421	344 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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