RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM219	Q86XT9	240 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KMT5C	Q86Y97	462 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATA20	Q8TB22	786 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	THAP6	Q8TBB0	222 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL17F	Q96PD4	163 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DUX5	Q96PT3	197 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABHD1	Q96SE0	405 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDRT15	Q96T59	188 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MEIS3	Q99687	375 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	APOL6	Q9BWW8	343 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD93	Q9NPY3	652 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SELENON	Q9NZV5	590 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HACL1	Q9UJ83	578 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITPR3	Q14573	2671 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PREX2	Q70Z35	1606 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		2.96	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NLRP1	Q9C000	1473 aa		2.96	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAF1	P21675	1872 aa		2.96	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACACB	O00763	2458 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	MIA2	Q96PC5	1412 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	C4orf47	A7E2U8	309 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACOT8	O14734	319 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAMDEC1	O15204	470 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	P4HA2	O15460	535 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAMTA2	O94983	1202 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	BMP10	O95393	424 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TPO	P07202	933 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL11	P20809	199 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNA5	P22460	613 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSD17B4	P51659	736 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARSE	P51690	589 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPOCK1	Q08629	439 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	COASY	Q13057	564 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLA2G7	Q13093	441 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTF2H2	Q13888	395 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF234	Q14588	700 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SYT16	Q17RD7	645 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRNP1	Q6NT89	227 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM171B	Q6P995	826 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP97	Q8IW35	865 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	2.96	□□□□□ -1.94	3e-7	■■■■■ 85.3
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	AVL9	Q8NBF6	648 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	GCNA	Q96QF7	691 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1W2PPE2	198 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1W2PR64	198 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1W2PR77	199 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	LNP1	A1A4G5	178 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR5K3	A6NET4	321 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	LILRA5	A6NI73	299 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494		H0YIN7	160 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	DVL1	O14640	695 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNHIT1	O43257	154 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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