RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 LRRC66Q68CR7 880 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SNX20Q7Z614 316 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SNX6Q9UNH7 406 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 F5P12259 2224 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 MAN1A2O60476 641 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 CLDN9O95484 217 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 HNF4AP41235 474 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 MAPK8P45983 427 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 EID3Q8N140 333 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 USP22Q9UPT9 525 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 A0A1B0GTL3 188 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 H6PDO95479 791 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 PRAMEF12O95522 483 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ALDH9A1P49189 494 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ACADVLP49748 655 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 CBX3Q13185 183 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 CHIT1Q13231 466 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 LRP8Q14114 963 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 LAPTM4AQ15012 233 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK9-209ENST00000556170 H3BNX3 289 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GLUD1P00367 558 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ADH1AP07327 375 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 POU1F1P28069 291 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 C11orf74Q86VG3 221 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CGREF1Q99674 301 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FAM234BA2RU67 622 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 K7EPI3 171 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SLC28A1O00337 649 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 COL6A1P12109 1028 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SLC6A2P23975 617 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GJA8P48165 433 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ARF5P84085 180 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 NFATC2Q13469 925 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PHKG1Q16816 387 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TAGAPQ8N103 731 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CD200R1Q8TD46 325 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 EXD2Q9NVH0 621 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MTRRQ9UBK8 725 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DHRS7Q9Y394 339 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TARM1B6A8C7 271 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TEX28O15482 410 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DFNA5O60443 496 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GPX3P22352 226 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PRKACGP22612 351 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MAPK1P28482 360 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TM4SF4P48230 202 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RAD23AP54725 363 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DMPKQ09013 629 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 HID1Q8IV36 788 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TRPV3Q8NET8 790 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 BIRC7Q96CA5 298 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PKMYT1Q99640 499 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms