RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137		E7EVH7	732 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MATN2	O00339	956 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RASSF9	O75901	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FGG	P02679	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	POLB	P06746	335 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	APRT	P07741	180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MSL3P1	P0C860	447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ETS1	P14921	441 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LIF	P15018	202 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SEPHS1	P49903	392 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SH3BP2	P78314	561 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CDK16	Q00536	496 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SNX1	Q13596	522 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	D2HGDH	Q8N465	521 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RECK	O95980	971 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FTH1	P02794	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRB1	P04280	392 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SFTPC	P11686	197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ACADL	P28330	430 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	STAT5A	P42229	794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MAGEA6	P43360	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPP1CA	P62136	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	HSD11B2	P80365	405 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FOXM1	Q08050	763 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GSE1	Q14687	1217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TBR1	Q16650	682 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TTC1	Q99614	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137		F8W8V4	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CEP104	O60308	925 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SPAG6	O75602	509 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MT-ND3	P03897	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF28	P17035	718 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TPSB2	P20231	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PDHA2	P29803	388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	NPY2R	P49146	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LMAN1	P49257	510 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MC1R	Q01726	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ACY1	Q03154	408 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LY6D	Q14210	128 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	EXD3	Q8N9H8	876 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms