RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	E2F3	O00716	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CFLAR	O15519	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	FFAR2	O15552	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TGM5	O43548	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE5A	O76074	875 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ASL	P04424	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	BMP2	P12643	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GRM2	Q14416	872 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CDKN3	Q16667	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM198	Q66K66	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	WNT16	Q9UBV4	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MYLK	Q15746	1914 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LEFTY2	O00292	366 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SNAP91	O60641	907 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	UGDH	O60701	494 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	XYLB	O75191	536 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CXCL14	O95715	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT6A	P02538	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT6B	P04259	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	C8A	P07357	584 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA5	P08758	320 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HIST1H2AD	P20671	130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	JAK1	P23458	1154 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPK1	P28482	360 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CA8	P35219	290 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CCR10	P46092	362 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT6C	P48668	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SGSH	P51688	502 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RBBP7	Q16576	425 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	FXN	Q16595	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL6	Q8TCB7	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	COPS8	Q99627	209 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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