RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC1A2P43004 574 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INHBCP55103 352 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KLHL35Q6PF15 583 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NAT14Q8WUY8 206 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C12orf66Q96MD2 445 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BIRC8Q96P09 236 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DKK4Q9UBT3 224 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.04■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM149AA5PLN7 773 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BANF1O75531 89 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 S1PR4O95977 384 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AOAHP28039 575 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CSF2RBP32927 897 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAPZBP47756 277 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPR18Q14330 331 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTP5Q14D33 572 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AMZ1Q400G9 498 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNJ9Q92806 393 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAB33BQ9H082 229 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMYND15Q9H091 742 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDP2Q9P2J9 529 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.03■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM1AO60341 852 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPC4O75487 556 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBXN7O94888 489 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLCO2B1O94956 709 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPN2P04844 631 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSTA2P09210 222 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 THRAP10827 490 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCR7P32248 378 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PREPP48147 710 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LIMK2P53671 638 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLTPP55058 493 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLDN6P56747 220 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFAP36Q96G28 342 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PWWP2AQ96N64 755 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.02■□□□□ 0.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHD8Q9HCK8 2581 aa16.02■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACACBO00763 2458 aa16.02■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 E5RI56 91 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MATN2O00339 956 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROS1P07225 676 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms