RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PPP2R2BQ00005 443 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM198Q66K66 360 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TEX11Q8IYF3 940 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 OR2T11Q8NH01 316 aa3.57□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.57□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 SH2D4AQ9H788 454 aa3.57□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 KAT14Q9H8E8 782 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 NDUFS4O43181 175 aa3.56□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 KRT9P35527 623 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 DCAF10Q5QP82 559 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SARM1Q6SZW1 724 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LSMEM2Q8N112 164 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 HSD17B8Q92506 261 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SGK494Q96LW2 274 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LIPT2A6NK58 231 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 KLF11O14901 512 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PIGNO95427 931 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 AGR2O95994 175 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 PIGQQ9BRB3 760 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ABHD6Q9BV23 337 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 HHATLQ9HCP6 504 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 AGRNO00468 2067 aa3.55□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 NMBRP28336 390 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PRAMEP78395 509 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PRKCZQ05513 592 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 OR4C3Q8NH37 302 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TBC1D16Q8TBP0 767 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 OR2A14Q96R47 310 aa3.54□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 CMAHPQ9Y471 501 aa3.54□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.53□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa3.53□□□□□ -1.84
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UBE2B-202ENST00000499038 PI15O43692 258 aa3.53□□□□□ -1.84
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