RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	TYRP1	P17643	537 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDHA2	P29803	388 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEA3	P43357	314 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	EPHA4	P54764	986 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	UCN	P55089	124 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	NFATC3	Q12968	1075 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CASC4	Q6P4E1	433 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	EXD3	Q8N9H8	876 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	AVL9	Q8NBF6	648 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	NCSTN	Q92542	709 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	C12orf66	Q96MD2	445 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	STRADB	Q9C0K7	418 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	UCK1	Q9HA47	277 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF14	Q9UBS8	474 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPTB	P11277	2137 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	THRA	P10827	490 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITGB6	P18564	788 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITIH1	P19827	911 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ETV5	P41161	510 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PREP	P48147	710 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	DR1	Q01658	176 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	JAML	Q86YT9	394 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT12	Q99456	494 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	IQCF5	A8MTL0	148 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325		A8MU76	341 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLD2	O14939	933 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	BANF1	O75531	89 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBXN7	O94888	489 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNFSF15	O95150	251 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	BRD3	Q15059	726 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	MSS51	Q4VC12	460 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELMO1	Q92556	727 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	RSC1A1	Q92681	617 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PWWP2A	Q96N64	755 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTC1	Q99614	292 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZMYND15	Q9H091	742 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDP2	Q9P2J9	529 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEB16	A2A368	324 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325		K7ENP7	123 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	QSOX1	O00391	747 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FTH1	P02794	183 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR56A5	P0C7T3	313 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCL4	P13236	92 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AMD1	P17707	334 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTPA	P49638	278 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GFER	P55789	205 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCGF5	Q86SE9	256 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM135	Q86UB9	458 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06

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