RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM170A	A1A519	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00473	A8K010	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		K7EQS6	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		M0QYG6	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EPHB6	O15197	1021 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MPPED1	O15442	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RTN2	O75298	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RNF8	O76064	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	APBB3	O95704	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SERPING1	P05155	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FYN	P06241	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CELA2A	P08217	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MYBL1	P10243	752 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GZMA	P12544	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GPD1	P21695	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MMP8	P22894	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TNFSF4	P23510	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NTSR1	P30989	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GRK6	P43250	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF81	P51508	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SATB1	Q01826	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DMC1	Q14565	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TAF5	Q15542	800 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CDO1	Q16878	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KAZN	Q674X7	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZS52	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ARC	Q7LC44	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SNX19	Q92543	992 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WBP2	Q969T9	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	COL4A2	P08572	1712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		H3BUI4	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms