RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	RCN1	Q15293	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SPA17	Q15506	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MED22	Q15528	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ALX1	Q15699	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PTGIS	Q16647	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CORO2A	Q92828	525 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MYH10	P35580	1976 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592		A0A087X1B8	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	SEPT4	O43236	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MGRN1	O60291	552 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	MTX2	O75431	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CIB2	O75838	187 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	DEXI	O95424	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	TTLL1	O95922	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CHRNA1	P02708	482 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	GSTA1	P08263	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	CYC1	P08574	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	FGF4	P08620	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	ANXA8	P13928	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	NR1D1	P20393	614 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTN4-215	ENST00000491592	RPA1	P27694	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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