RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416893.2

ATG4AP1-201, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ATG4AP1, Length 538 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMEM25Q86YD3 366 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CD101Q93033 1021 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 P2RY11Q96G91 374 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 VMP1Q96GC9 406 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 Q96MF0 132 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SERPINB11Q96P15 392 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CASS4Q9NQ75 786 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 RLIMQ9NVW2 624 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 PLK2Q9NYY3 685 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 IFNKQ9P0W0 207 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 RAB21Q9UL25 225 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ASXL3Q9C0F0 2248 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 A0A088AWK7 358 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRD1A4D1F6 860 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRC53A6NM62 1247 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 H3BQF6 201 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NDUFAB1O14561 156 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CAPN9O14815 690 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 IRAK2O43187 625 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CACNG3O60359 315 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TULP3O75386 442 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 DAB1O75553 588 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 UBXN7O94888 489 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 KAT7O95251 611 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 LATS1O95835 1130 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 IGLV3-25P01717 112 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 IGLV3-27P01718 113 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 APODP05090 189 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 GSTA2P09210 222 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TYRP1P17643 537 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 MMP8P22894 467 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CHKAP35790 457 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ACADVLP49748 655 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF75DP51815 510 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CCNG1P51959 295 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBX4P57082 545 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 PDE1BQ01064 536 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NHLH1Q02575 133 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 FOXI1Q12951 378 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPCS2Q15005 226 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 BCL2A1Q16548 175 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 FBXO43Q4G163 708 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SMUG1Q53HV7 270 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 DCAF6Q58WW2 860 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 Q6ZNX1 250 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 C14orf80Q86SX3 495 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 HOOK3Q86VS8 718 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ERICH1Q86X53 443 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 PDSS2Q86YH6 399 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 DEFB106AQ8N104 65 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 NDUFAF2Q8N183 169 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 CPXM2Q8N436 756 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms