RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GVM2 712 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TLE3Q04726 772 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGN3Q15651 99 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GPRC6AQ5T6X5 926 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OXR1Q8N573 874 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 KLQ9UEF7 1012 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 U3KQV3 271 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB561D2O14569 222 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00032P0C843 101 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IRF8Q02556 426 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FSTL1Q12841 308 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM171BQ6P995 826 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 USP30Q70CQ3 517 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PPCDCQ96CD2 204 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRB1O14514 1584 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C12orf71A8MTZ7 269 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PGLSO95336 258 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.732e-6■■□□□ 14.3
SH3BP2-201ENST00000356331 CRADDP78560 199 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BCL2L1Q07817 233 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GPAT3Q53EU6 434 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A10Q63ZE4 541 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TLDC1Q6P9B6 456 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AVL9Q8NBF6 648 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LHX5Q9H2C1 402 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FNIP2Q9P278 1114 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPB11Q9Y547 144 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RP1P56715 2156 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GNAO1P09471 354 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GIMD1P0DJR0 217 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CD36P16671 472 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMB4P28070 264 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C3P1Q6ZMU1 363 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 WNT8BQ93098 351 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C16orf58Q96GQ5 468 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FUOMA2VDF0 154 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM149AA5PLN7 773 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIN3BO60391 1043 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OAZ2O95190 189 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GKN3PP0CG01 181 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1G1P47890 313 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 KHKP50053 298 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CCR4P51679 360 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SGCGQ13326 291 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ASB18Q6ZVZ8 466 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DERAQ9Y315 318 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IL7P13232 177 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AOC1P19801 751 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HTR2BP41595 481 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DCDC1P59894 354 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP2R2BQ00005 443 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR51D1Q8NGF3 324 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF31Q96EP0 1072 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ITPAQ9BY32 194 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP11A1P05108 521 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TFEBP19484 476 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PROZP22891 400 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf80Q0P641 193 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC23BQ15437 767 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 EMC10Q5UCC4 262 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HACD4Q5VWC8 232 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF773Q6PK81 442 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 VSTM1Q6UX27 236 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms