RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ANK1P16157 1881 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SHMT2P34897 504 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CPA2P48052 419 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IRAK1P51617 712 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL1Q15170 157 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC38Q5VT99 294 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 BBS12Q6ZW61 710 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SNX20Q7Z614 316 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 USP7Q93009 1102 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RELTQ969Z4 430 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN23Q96B33 292 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SNF8Q96H20 258 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SMC6Q96SB8 1091 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NDNQ99608 321 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SARDHQ9UL12 918 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HS3ST2Q9Y278 367 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8RI6L899 631 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC1I1O14576 645 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA4LO95757 839 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PDHA1P08559 390 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IL1R2P27930 398 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G16P53816 162 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CDK3Q00526 305 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 LRP8Q14114 963 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 QPCTQ16769 361 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GPR33Q49SQ1 333 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 XKR6Q5GH73 641 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 POTEHQ6S545 545 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF567Q8N184 647 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRR7Q8TB68 274 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HM13Q8TCT9 377 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2E3Q969T4 207 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 FMO2Q99518 471 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STOML1Q9UBI4 398 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTQ1 180 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CES2O00748 559 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GUCY1B2O75343 617 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TTC4O95801 387 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 F3P13726 295 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ITIH1P19827 911 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCL7P80098 99 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NFE2L1Q14494 772 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRCAPQ14761 206 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SGCBQ16585 318 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RAB6CQ53S08 254 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GPSM1Q86YR5 675 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ESX1Q8N693 406 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KDM1BQ8NB78 822 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PATE1Q8WXA2 126 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TTC17Q96AE7 1141 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PDXPQ96GD0 296 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CYTH2Q99418 400 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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