RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.54■■□□□ 1.36
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CCDC71L-201ENST00000315965 RDH11Q8TC12 318 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.54■■□□□ 1.36
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CCDC71L-201ENST00000315965 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 KCNK6Q9Y257 313 aa23.52■■□□□ 1.36
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CCDC71L-201ENST00000315965 TARM1B6A8C7 271 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CCDC71L-201ENST00000315965 SBK3P0C264 359 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 CPA3P15088 417 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 GYS2P54840 703 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 C21orf59P57076 290 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 FOPNLQ96NB1 174 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71L-201ENST00000315965 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.52■■□□□ 1.36
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CCDC71L-201ENST00000315965 SP140Q13342 867 aa23.51■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 ASB11Q8WXH4 323 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.5■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 PRR19A6NJB7 356 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC16A5O15375 505 aa23.5■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 ABRQ12979 859 aa23.5■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF542PQ5EBM4 170 aa23.49■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 OARD1Q9Y530 152 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR91A4D1P6 747 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 GFYI3L273 518 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 SMIM24O75264 130 aa23.48■■□□□ 1.35
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CCDC71L-201ENST00000315965 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCDC71L-201ENST00000315965 CYP2A7P20853 494 aa23.48■■□□□ 1.35
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