RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 GALPQ9UBC7 116 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 C3orf18Q9UK00 162 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 DFNA5O60443 496 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 UPK1BO75841 260 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MT-ND2P03891 347 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PTPN2P17706 415 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 GGT1P19440 569 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MASP1P48740 699 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CLCA4Q14CN2 919 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SYT16Q17RD7 645 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ANKS6Q68DC2 871 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ATL1Q8WXF7 558 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NCLNQ969V3 563 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TXNDC15Q96J42 360 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RNF38Q9H0F5 515 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PARVBQ9HBI1 364 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 HPRP00739 348 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 GGT5P36269 586 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF691Q5VV52 312 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MICU2Q8IYU8 434 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 OR2T12Q8NG77 320 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FAM162AQ96A26 154 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF583Q96ND8 569 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TMEM209Q96SK2 561 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF225Q9UK10 706 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PADI3Q9ULW8 664 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NOD1Q9Y239 953 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FAM234BA2RU67 622 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MFN2O95140 757 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ITGB1P05556 798 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 KCNA10Q16322 511 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 XKR4Q5GH76 650 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TSPEARQ8WU66 669 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 YIPF6Q96EC8 236 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 VAPAQ9P0L0 249 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.52□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CDC7O00311 574 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DYRK3O43781 588 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CCNKO75909 580 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 F9P00740 461 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 LCKP06239 509 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 G6PDP11413 515 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CD36P16671 472 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ALOX12P18054 663 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DCTP40126 519 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CASP3P42574 277 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DSC2Q02487 901 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DET1Q7L5Y6 550 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MYOCQ99972 504 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 H0Y626 953 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 VPS4BO75351 444 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TRIM16O95361 564 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC2A3P11169 496 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 EPS8Q12929 822 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SEMA3AQ14563 771 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms