RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM129BQ96TA1 746 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRX2Q99811 253 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OLAHQ9NV23 265 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX13Q9Y5W8 968 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WXM4 84 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN5P54829 565 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP15Q460N3 678 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 DHFR2Q86XF0 187 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CALML6Q8TD86 181 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ELMO2Q96JJ3 720 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TBCCD1Q9NVR7 557 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MRASO14807 208 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NRP2O60462 931 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK6P29122 969 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NNMTP40261 264 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 METAP1P53582 386 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 EMP3P54852 163 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 AGKQ53H12 422 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT7Q86SF2 657 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO4A1Q96BD0 722 aa25.92■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCF12Q99081 682 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 FBP2O00757 339 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TTKP33981 857 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A3P40879 764 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RETSATQ6NUM9 610 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CNSTQ6PJW8 725 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T3Q8NH03 318 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PDFQ9HBH1 243 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SUN2Q9UH99 717 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PRORSD1PA6NEY8 169 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP12BA6NM10 295 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 F7P08709 466 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPDH2P12268 514 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ETFBP38117 255 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NHSL2Q5HYW2 709 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PAOXQ6QHF9 649 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP12AQ8IXF9 295 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CAAP1Q9H8G2 361 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM233B4DJY2 109 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R39P59534 338 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP1Q00013 466 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC14A2Q15849 920 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf39Q6P5X5 142 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 TFAP2CQ92754 450 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHAC1Q9H158 963 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PLGRKTQ9HBL7 147 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC1A2P43004 574 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 VASPP50552 380 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 STX1BP61266 288 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAP2Q15057 778 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 POM121L1PQ3SYA9 428 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MTX3Q5HYI7 312 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CUZD1Q86UP6 607 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND6AQ8IWF6 608 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SIPA1Q96FS4 1042 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 IL12RB2Q99665 862 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH6Q9H252 994 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa25.89■■□□□ 1.74
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