RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DOK6Q6PKX4 331 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf96Q7Z7L8 435 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GJD3Q8N144 294 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 DLG3Q92796 817 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GLMNQ92990 594 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CNDP1Q96KN2 507 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB2Q96Q27 587 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-6Q9BXR3 956 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CD320Q9NPF0 282 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 STK25O00506 426 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA4LO95757 839 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FRA10AC1Q70Z53 315 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 LSMEM2Q8N112 164 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM159Q96B96 161 aa24.41■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 APOOQ9BUR5 198 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RDH14Q9HBH5 336 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NPHS2Q9NP85 383 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 STX16O14662 325 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF217O75362 1048 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNGP07510 517 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCR10P46092 362 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SYTL3Q4VX76 610 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC50Q53HI1 259 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP157Q5JU67 520 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 XKR5Q6UX68 686 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGRP3Q8IV61 690 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2L2Q8NH16 312 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB11Q8WXH4 323 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTO2Q9H4Y5 243 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CD274Q9NZQ7 290 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM8A1Q9UBU6 413 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 C8GP07360 202 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 LRRTM4Q86VH4 590 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 MYOCQ99972 504 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 HAO1Q9UJM8 370 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT4DA6NG13 374 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GFYI3L273 518 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A5O15375 505 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FFAR2O15552 330 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX2O60749 519 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-215ENST00000628018 APBB3O95704 486 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CD6P30203 668 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PREPP48147 710 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP8P85298 464 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-215ENST00000628018 SETDB1Q15047 1291 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 HM13Q8TCT9 377 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 COG4Q9H9E3 785 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SIT1Q9Y3P8 196 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 POM121BA6NF01 834 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FPGTO14772 594 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT7LO94864 414 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV4-34P06331 123 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MTAPQ13126 283 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.38■■□□□ 1.49
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