RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
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RABGEF1-209ENST00000607882 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
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RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa12.38□□□□□ -0.43
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RABGEF1-209ENST00000607882 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
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RABGEF1-209ENST00000607882 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC13A1Q9BZW2 595 aa12.36□□□□□ -0.43
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