RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	PTPRC	P08575	1304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	CLDN4	O14493	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	S1PR1	P21453	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	SSTR2	P30874	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	HNF4A	P41235	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	MMP13	P45452	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ASCL1	P50553	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	CPNE1	Q99829	537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SENP1-208	ENST00000551592	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TCF4	P15884	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PTPN3	P26045	913 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CD81	P60033	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TWIST1	Q15672	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	WASF1	Q92558	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GNAZ	P19086	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MPZ	P25189	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SLC9A3	P48764	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	AMPH	P49418	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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