RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	CTSV	O60911	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPF	P07098	398 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ARSE	P51690	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	RASA2	Q15283	850 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NODAL	Q96S42	347 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	P2RY10	O00398	339 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZWINT	O95229	277 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GCNT3	O95395	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	VPREB1	P12018	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	IL11	P20809	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LIG4	P49917	911 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP15	P51511	669 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SIRPA	P78324	504 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GRAP	Q13588	217 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MELK	Q14680	651 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP28	Q9H239	520 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PPI3	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		H0YIN7	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	T	O15178	435 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR137B	O60478	399 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CREG1	O75629	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	BCL10	O95999	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LDLR	P01130	860 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NR1D1	P20393	614 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	UBXN2A	P68543	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PTER	Q96BW5	349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ALG14	Q96F25	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP27	Q9H306	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SSX4	O60224	188 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TPO	P07202	933 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	UMOD	P07911	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GJA1	P17302	382 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CAPZA2	P47755	286 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PHEX	P78562	749 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KLC3	Q6P597	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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