RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A9O60656 530 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 LCA5LO95447 670 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A6P19224 532 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A1P22309 533 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A4P22310 534 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 TAS2R40P59535 323 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 ADCY2Q08462 1091 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 NCF4Q15080 339 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 HGSNATQ68CP4 663 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 SLC34A3Q8N130 599 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 C12orf66Q96MD2 445 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 RNF157Q96PX1 679 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 RANBP9Q96S59 729 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
NELFE-210ENST00000491139 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 C9J4A7 227 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 F5H423 210 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PMPCBO75439 489 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PROSCO94903 275 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ALPPP05187 535 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 CYP2A7P20853 494 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 CDH3P22223 829 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PRKAA1Q13131 559 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PPP2R5EQ16537 467 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PLD5Q8N7P1 536 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 OR1L3Q8NH93 324 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 WWP1Q9H0M0 922 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 TRABDQ9H4I3 376 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.26■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 KLHL41O60662 606 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 HLA-DPA1P20036 260 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 KDELR1P24390 212 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 OTX2P32243 289 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SPAM1P38567 509 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PREPP48147 710 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PDK1Q15118 436 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 NFKBIBQ15653 356 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 RAPGEF5Q92565 580 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 IP6K3Q96PC2 410 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PHF12Q96QT6 1004 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 GLOD4Q9HC38 313 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 POMT2Q9UKY4 750 aa20.25■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 A0A087X0T9 212 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 MGAT4DA6NG13 374 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 MAP3K7O43318 606 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 FAM228BP0C875 321 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 UBP1Q9NZI7 540 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.24■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SMTNL1A8MU46 457 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 MATN2O00339 956 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 GPR39O43194 453 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 MSL3P1P0C860 447 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 AGXTP21549 392 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 NDUFS1P28331 727 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 HADHAP40939 763 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 ITGA9Q13797 1035 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 KRT33BQ14525 404 aa20.23■□□□□ 0.83
NELFE-210ENST00000491139 GSE1Q14687 1217 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms