RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AAK1Q2M2I8 961 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZVU0 165 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIER2Q8N344 545 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO19Q96H55 970 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM74Q96NL1 305 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF599Q96NL3 588 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INPP4BO15327 924 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB7O75635 380 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT2B4P06133 528 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNAO1P09471 354 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HK3P52790 923 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMPKQ09013 629 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACUL1Q86Y37 369 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPOQ9BU64 300 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB8Q9H765 288 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXTRP30559 389 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RELAQ04206 551 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD300CQ08708 224 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBR4Q8N4T8 237 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM47BQ8NA70 645 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPHS2Q99611 448 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.29■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00271P0C7V0 271 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACVR1Q04771 509 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf87Q6PH81 154 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZNB5 142 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHST9Q7L1S5 443 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F5P12259 2224 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRB3O75022 631 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPOP01588 193 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENTPD1P49961 510 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCL2L1Q07817 233 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFYCQ13952 458 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POF1BQ8WVV4 589 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CIPCQ9C0C6 399 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD8Q9NX08 183 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD274Q9NZQ7 290 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD300AQ9UGN4 299 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKP3Q9Y446 797 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.28■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM23O75077 832 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T3Q8NH03 318 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYGBQ8WWM9 190 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BBS2Q9BXC9 721 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC3Q9BY71 257 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASAH2Q9NR71 780 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTM6Q9NX76 183 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CROCCQ5TZA2 2017 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSAP10619 480 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LBPP18428 481 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A1P30825 629 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UFM1P61960 85 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCQQ04759 706 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNA6Q15825 494 aa15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms