RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462993.1

SNX10-208, Transcript of sorting nexin 10, human

TSL 1 (best)

Gene SNX10, Length 806 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX10-208	ENST00000462993	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	P2RX5	Q93086	422 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	VCAN	P13611	3396 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993		I3L4J1	428 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TAF4	O00268	1085 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TADA2A	O75478	443 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CLEC3B	P05452	202 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PRR35	P0CG20	571 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	EPCAM	P16422	314 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KEL	P23276	732 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	AXL	P30530	894 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CPOX	P36551	454 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PRPH	P41219	470 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	POLD2	P49005	469 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CENPA	P49450	140 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CLCNKB	P51801	687 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ARPP19	P56211	112 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PDIA5	Q14554	519 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	EME1	Q96AY2	570 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	DHX58	Q96C10	678 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993		A0A0G2JK05	382 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNX10-208	ENST00000462993		A0A1B0GUA9	196 aa		4.24	□□□□□ -1.73

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