RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446233.1

UBQLN4P2-201, Transcript of ubiquilin 4 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene UBQLN4P2, Length 948 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4P2-201ENST00000446233 MFSD11O43934 449 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HLA-DQB2P05538 268 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HBQ1P09105 142 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RARAP10276 462 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 BPIP17213 487 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AGXTP21549 392 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 KRT31Q15323 416 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NXPE1Q8N323 547 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FAM71BQ8TC56 605 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HSPH1Q92598 858 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PPM1MQ96MI6 270 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF711Q9Y462 761 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.99□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OR6C74A6NCV1 312 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 MATN2O00339 956 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF749O43361 778 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CD63P08962 238 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CCDC172P0C7W6 258 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 COX6B1P14854 86 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FERP16591 822 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FOLR3P41439 243 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CD86P42081 329 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PREPP48147 710 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GALNT3Q14435 633 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HIF1AQ16665 826 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 METRNLQ641Q3 311 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NEK11Q8NG66 645 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NACC2Q96BF6 587 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SCINQ9Y6U3 715 aa9.98□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DNHD1Q96M86 4753 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GTF3C1Q12789 2109 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 E7EQ34 232 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 H3BMH7 237 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AGPSO00116 658 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 MASP2O00187 686 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LDB2O43679 373 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 JRKO75564 520 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PIRTP0C851 137 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CAPN3P20807 821 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CDH3P22223 829 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HTR1EP28566 365 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TDGF1P3P51864 188 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CDC16Q13042 620 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 XRCC4Q13426 336 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GTF2H3Q13889 308 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NFE2L1Q14494 772 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PTERQ96BW5 349 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF653Q96CK0 615 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TTC25Q96NG3 672 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GBP5Q96PP8 586 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OLAHQ9NV23 265 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HCFC1P51610 2035 aa9.97□□□□□ -0.81
UBQLN4P2-201ENST00000446233 KLHL33A6NCF5 533 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms