RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 TCF25Q9BQ70 676 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 IRAK3Q9Y616 596 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 HIDE1A8MVS5 230 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FXYD1O00168 92 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NR5A2O00482 541 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 GRM6O15303 877 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RAD51BO15315 384 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MAN1A2O60476 641 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CCNKO75909 580 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 IST1P53990 364 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 GNG2P59768 71 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 BNIPLQ7Z465 357 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NAT16Q8N8M0 369 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SPERTQ8NA61 448 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NT5C3BQ969T7 300 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NODALQ96S42 347 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 DSN1Q9H410 356 aa16.61■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FAM92AA1XBS5 289 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ANGPT2O15123 496 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 USP12O75317 370 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CXCL14O95715 111 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ALPLP05186 524 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MATKP42679 507 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SCD5Q86SK9 330 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC58Q96CX6 371 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CHID1Q9BWS9 393 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 BTBD2Q9BX70 525 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PTTG1O95997 202 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MT-ND1P03886 318 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 BMP1P13497 986 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ERVK-21P61565 698 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FOXM1Q08050 763 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MEP1AQ16819 746 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PID1Q7Z2X4 250 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 LGI2Q8N0V4 545 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SVOPQ8N4V2 548 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CASS4Q9NQ75 786 aa16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 AP2A1O95782 977 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RB1P06400 928 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 IRS1P35568 1242 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RAB10P61026 200 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 KIF19Q2TAC6 998 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 GIPC2Q8TF65 315 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NMUR1Q9HB89 426 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 OSER1Q9NX31 292 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SCML2Q9UQR0 700 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 EVPLLA8MZ36 301 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 GOT1P17174 413 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 POLD2P49005 469 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 GSK3BP49841 420 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 VBP1P61758 197 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CREMQ03060 361 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 UBE3AQ05086 875 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CRY1Q16526 586 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 LILRA6Q6PI73 481 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 EGLN2Q96KS0 407 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 RDH12Q96NR8 316 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NPY6RQ99463 290 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms